MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-7 DNA

Total Repeats: 221

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020824	CCT	2	6	3	8	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_020824	TAC	2	6	24	29	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020824	ATA	2	6	33	38	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020824	TAAAG	2	10	74	83	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020824	CAA	2	6	100	105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020824	AAG	2	6	172	177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020824	AAT	2	6	204	209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020824	A	7	7	215	221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020824	TAC	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020824	GAT	2	6	460	465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020824	TAATT	2	10	478	487	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020824	ACC	2	6	596	601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279710
13	NC_020824	ACC	2	6	614	619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279710
14	NC_020824	TAACTT	2	12	688	699	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	472279710
15	NC_020824	A	8	8	735	742	100 %	0 %	0 %	0 %	472279710
16	NC_020824	T	6	6	773	778	0 %	100 %	0 %	0 %	472279710
17	NC_020824	AGT	2	6	824	829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279710
18	NC_020824	AGTA	2	8	860	867	50 %	25 %	25 %	0 %	472279710
19	NC_020824	TGT	2	6	895	900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279710
20	NC_020824	A	6	6	905	910	100 %	0 %	0 %	0 %	472279710
21	NC_020824	CCT	2	6	926	931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_020824	AGA	2	6	1000	1005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020824	TTG	2	6	1079	1084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020824	ATG	2	6	1106	1111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020824	T	6	6	1139	1144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020824	AGT	2	6	1148	1153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020824	ATT	2	6	1161	1166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020824	CTT	2	6	1193	1198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020824	GAGT	2	8	1253	1260	25 %	25 %	50 %	0 %	472279711
30	NC_020824	TTCA	2	8	1324	1331	25 %	50 %	0 %	25 %	472279711
31	NC_020824	GCT	2	6	1407	1412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279711
32	NC_020824	TTCC	2	8	1442	1449	0 %	50 %	0 %	50 %	472279711
33	NC_020824	AATT	2	8	1524	1531	50 %	50 %	0 %	0 %	472279711
34	NC_020824	CAAG	2	8	1666	1673	50 %	0 %	25 %	25 %	472279711
35	NC_020824	TGT	2	6	1724	1729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020824	TCATT	2	10	1812	1821	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_020824	A	6	6	1837	1842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020824	GTT	2	6	1869	1874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020824	T	6	6	1873	1878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020824	AC	3	6	1895	1900	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_020824	AAC	2	6	1901	1906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020824	A	7	7	1929	1935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020824	CAAA	2	8	1959	1966	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_020824	TTTC	2	8	1991	1998	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_020824	TAAC	2	8	2022	2029	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_020824	TTTAA	2	10	2044	2053	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020824	AAT	2	6	2060	2065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020824	A	8	8	2097	2104	100 %	0 %	0 %	0 %	472279712
49	NC_020824	TGA	2	6	2119	2124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279712
50	NC_020824	TGCT	2	8	2127	2134	0 %	50 %	25 %	25 %	472279712
51	NC_020824	TGA	2	6	2188	2193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279712
52	NC_020824	A	6	6	2238	2243	100 %	0 %	0 %	0 %	472279712
53	NC_020824	AAG	2	6	2247	2252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279712
54	NC_020824	ATT	2	6	2255	2260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279712
55	NC_020824	TTTTG	2	10	2314	2323	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020824	CTG	2	6	2353	2358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020824	TTA	2	6	2404	2409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020824	A	6	6	2562	2567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020824	AACG	2	8	2645	2652	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_020824	GTG	2	6	2749	2754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020824	ACT	2	6	2951	2956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020824	AATT	2	8	2974	2981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020824	AGG	2	6	2992	2997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020824	GAAAT	2	10	3008	3017	60 %	20 %	20 %	0 %	472279713
65	NC_020824	ATTT	2	8	3080	3087	25 %	75 %	0 %	0 %	472279713
66	NC_020824	T	7	7	3085	3091	0 %	100 %	0 %	0 %	472279713
67	NC_020824	ATT	2	6	3094	3099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279713
68	NC_020824	A	6	6	3221	3226	100 %	0 %	0 %	0 %	472279713
69	NC_020824	T	6	6	3277	3282	0 %	100 %	0 %	0 %	472279713
70	NC_020824	AGA	2	6	3318	3323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279713
71	NC_020824	AGT	2	6	3424	3429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279713
72	NC_020824	AGA	2	6	3495	3500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279713
73	NC_020824	T	6	6	3502	3507	0 %	100 %	0 %	0 %	472279713
74	NC_020824	AGA	2	6	3582	3587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279713
75	NC_020824	A	7	7	3621	3627	100 %	0 %	0 %	0 %	472279713
76	NC_020824	AGAAA	2	10	3681	3690	80 %	0 %	20 %	0 %	472279713
77	NC_020824	GC	3	6	3786	3791	0 %	0 %	50 %	50 %	472279713
78	NC_020824	A	7	7	3868	3874	100 %	0 %	0 %	0 %	472279713
79	NC_020824	CAAG	2	8	3883	3890	50 %	0 %	25 %	25 %	472279713
80	NC_020824	AAG	2	6	3893	3898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279713
81	NC_020824	TGA	2	6	3958	3963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279714
82	NC_020824	CAA	2	6	4038	4043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279714
83	NC_020824	GTTGAT	2	12	4061	4072	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	472279714
84	NC_020824	TCA	2	6	4109	4114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279714
85	NC_020824	CAA	2	6	4127	4132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279714
86	NC_020824	GAT	2	6	4136	4141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279714
87	NC_020824	GAC	2	6	4145	4150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279714
88	NC_020824	A	6	6	4154	4159	100 %	0 %	0 %	0 %	472279714
89	NC_020824	AAAG	2	8	4225	4232	75 %	0 %	25 %	0 %	472279714
90	NC_020824	CAA	2	6	4256	4261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279714
91	NC_020824	ACAA	2	8	4278	4285	75 %	0 %	0 %	25 %	472279714
92	NC_020824	GAA	2	6	4292	4297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279714
93	NC_020824	ATA	2	6	4347	4352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279714
94	NC_020824	AAG	2	6	4359	4364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279714
95	NC_020824	ACAA	2	8	4374	4381	75 %	0 %	0 %	25 %	472279714
96	NC_020824	AACCTA	2	12	4413	4424	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	472279714
97	NC_020824	GTG	2	6	4429	4434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279714
98	NC_020824	A	6	6	4459	4464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020824	AGA	2	6	4469	4474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020824	ATT	2	6	4553	4558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020824	TGG	2	6	4560	4565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020824	A	6	6	4601	4606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020824	CGAA	2	8	4684	4691	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_020824	T	6	6	4780	4785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020824	ATT	2	6	4789	4794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020824	TCA	2	6	4799	4804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279715
107	NC_020824	ATC	2	6	4835	4840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279715
108	NC_020824	TCT	2	6	4848	4853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279715
109	NC_020824	GTT	2	6	4988	4993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279715
110	NC_020824	TTC	2	6	5116	5121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279715
111	NC_020824	CATC	2	8	5130	5137	25 %	25 %	0 %	50 %	472279715
112	NC_020824	TTA	2	6	5287	5292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020824	TTAT	2	8	5341	5348	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020824	TAAA	2	8	5408	5415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020824	TTTA	2	8	5429	5436	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020824	TAAAT	2	10	5529	5538	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020824	A	6	6	5546	5551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020824	AT	3	6	5572	5577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020824	AT	3	6	5687	5692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020824	TATT	2	8	5718	5725	25 %	75 %	0 %	0 %	472279716
121	NC_020824	T	6	6	5741	5746	0 %	100 %	0 %	0 %	472279716
122	NC_020824	A	6	6	5775	5780	100 %	0 %	0 %	0 %	472279716
123	NC_020824	TAA	3	9	5794	5802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279716
124	NC_020824	T	6	6	5827	5832	0 %	100 %	0 %	0 %	472279716
125	NC_020824	ACA	2	6	5913	5918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279716
126	NC_020824	T	8	8	5981	5988	0 %	100 %	0 %	0 %	472279716
127	NC_020824	CTG	2	6	5993	5998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279716
128	NC_020824	T	7	7	6004	6010	0 %	100 %	0 %	0 %	472279716
129	NC_020824	CAA	2	6	6067	6072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279716
130	NC_020824	TTA	2	6	6073	6078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279716
131	NC_020824	GAAT	2	8	6089	6096	50 %	25 %	25 %	0 %	472279716
132	NC_020824	A	7	7	6128	6134	100 %	0 %	0 %	0 %	472279716
133	NC_020824	ATA	2	6	6177	6182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279716
134	NC_020824	A	6	6	6249	6254	100 %	0 %	0 %	0 %	472279716
135	NC_020824	A	8	8	6269	6276	100 %	0 %	0 %	0 %	472279716
136	NC_020824	T	6	6	6331	6336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020824	A	6	6	6347	6352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020824	AT	4	8	6378	6385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020824	TTA	2	6	6401	6406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020824	GCG	2	6	6448	6453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279717
141	NC_020824	AAG	2	6	6476	6481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279717
142	NC_020824	ACC	2	6	6552	6557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279717
143	NC_020824	TCA	3	9	6598	6606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279717
144	NC_020824	TAA	2	6	6658	6663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279717
145	NC_020824	TAA	2	6	6668	6673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279717
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.